在水產養殖環境中的作用穩固水體菌藻相平衡：碳是藻類十分重要的營養元素，相當于是藻類的骨架。向水體中補充含碳源的物質能夠補充有機碳，穩固水體菌藻相平衡，進而穩定水體的pH。例如很多水產養殖池塘中如果水中缺碳，藻類生長緩慢或者不穩定，補充像乙酸鈉這樣的碳源，可以為藻類的生長提供必要的碳元素，促進藻類的光合作用，增加水中的溶氧量；同時維持有益微生物在水體中的比例和活性，防止因天氣突變等原因引起水質的劇烈變化，起到穩定養殖水體生態環境的作用。促進有益微生物和藻類繁殖：水體中的碳源富含發酵蛋白、同城氨基酸和還原糖時，能有助于促進有益藻類和微生物的繁殖生長，穩定水色。水產養殖中的藻類可以為養殖生物提供氧氣、本地作為食物來源等重要作用，有益微生物則有助于分解水體中的有害物質、本地調節水體生態環境等，所以碳源通過促進它們的生長對整個養殖環境產生積極影響，如新生成的有益微生物能夠分解殘餌、糞便等，防止水中有機物的過度積累。